W czasie oblężenia miasta przez wojska radzieckie w 1945. kościół św. Mikołaja został zniszczony w 60%. Po wojnie przystąpiono do odbudowy.
W 1992 biskup toruński Andrzej Suski podniósł kościół do godności kolegiaty i erygował Kapitułę Kolegiacką Grudziądzką. Wielkim wydarzeniem religijnym dla parafii były Misje Ewangelizacyjne oraz peregrynacja figury Matki Bożej Fatimskiej. W Roku Jubileuszowym fara grudziądzka była jednym z kościołów stacyjnych. Przybywały do niej pielgrzymki z całej diecezji celem uzyskania odpustu jubileuszowego. W kościele szczególną czcią otaczany jest łaskami słynący obraz Matki Bożej Grudziądzkiej. Ostatnie lata to czas wielu gruntownych remontów i inwestycji, takich jak pokrycie sygnaturki blachą miedzianą, malowanie kościoła i budynków parafialnych, renowacja zewnętrznych ścian świątyni, remont kapitalny organów, malowanie budynków parafialnych, nowe ogrodzenie cmentarza (1/2 całości) i nowa nawierzchnia kamienna wokół kościoła.
Ruchy i Stowarzyszenia Akcja Katolicka, Stowarzyszenie Rodzin Katolickich, Katolickie Stowarzyszenie Młodzieży, Ruch Światło – Życie, Schola, Chór "Kolegiata", Koło Ministranckie, Lektorzy, Żywy Różaniec, Franciszkański Zakon Świeckich, Zespół Charytatywny Caritas
Linki zewnętrzne Parafia na stronie diecezji toruńskiej
Grudziądz Mikołaja