Nowy kościół z wieżą wybudowano dopiero w latach 1724–1727 i nadano mu wezwanie Nawiedzenia Najświętszej Maryi Panny. Kolejne straty kompleks kościelno-klasztorny poniósł podczas walk o Lwów w 1769, kiedy to miasto próbowali zdobyć, bez powodzenia, konfederaci barscy. Spłonęła wówczas m.in. wieża kościelna. Kościoła już nigdy nie odbudowano.
W 1772, w momencie zajęcia Lwowa przez Austriaków w wyniku pierwszego rozbioru Polski w głównym konwencie prowincji ruskiej pw. św. Józefa żyło 52 karmelitów trzewiczkowych.
W 1784 w wyniku reform józefińskich przeprowadzonych przez cesarza Józefa II władze austriackie skasowały klasztor karmelitów, zamieniając go na więzienie. Przy kościele natomiast istniała jeszcze przez 5 lat parafia, przeniesiona następnie do kościoła św. Andrzeja.
Zrujnowany kościół rozebrano w 1876.
Pod koniec XIX w. do budynku klasztornego dobudowano gmach Sądu Karnego wg projektu Franciszka Skowrona.
Po 1945 budynek klasztorny został przekazany w użytkowanie Politechnice Lwowskiej.
Zobacz też Kościół Nawiedzenia Najświętszej Marii Panny we Lwowie
Bibliografia Ryszard Chanas, Janusz Czerwiński, Lwów. Przewodnik turystyczny, wyd. Ossolineum 1992, Wrocław, Bartłomiej Kaczorowski, Zabytki starego Lwowa, wyd.