Państwa pragnące brać udział w stałej współpracy strukturalnej notyfikują swój zamiar Radzie Unii Europejskiej i wysokiemu przedstawicielowi Unii do spraw zagranicznych i polityki bezpieczeństwa. W ciągu trzech miesięcy od notyfikacji Rada UE, stanowiąc większością kwalifikowaną po konsultacji z wysokim przedstawicielem, uchwala decyzję ustanawiającą stałą współpracę strukturalną i określającą listę jej uczestników. Każde państwo, które spełnia kryteria, może dołączyć do stałej współpracy strukturalnej. Musi wówczas notyfikować swój zamiar Radzie UE i wysokiemu przedstawicielowi. Rada UE podejmuje decyzję potwierdzającą udział danego państwa większością kwalifikowaną po konsultacji z wysokim przedstawicielem. W głosowaniu biorą udział jedynie państwa biorące udział w stałej współpracy strukturalnej. W przypadku stwierdzenia, że państwo uczestniczące we współpracy nie spełnia już warunków, uczestnictwo tego państwa może zostać zawieszone. O zawieszeniu decyduje Rada UE większością kwalifikowaną. W głosowaniu biorą udział państwa uczestniczące we współpracy, z wyjątkiem państwa zainteresowanego.