Po protestach na Ukrainie, które zakończyły się w lutym 2014 upadkiem rządów Wiktora Janukowycza, Filaret wystosował do Ukraińskiego Kościoła Prawosławnego Patriarchatu Moskiewskiego apel o podjęcie rozmów na rzecz budowy jednej kanonicznej Cerkwi na Ukrainie. Został on przyjęty pozytywnie, a Ukraiński Kościół Prawosławny Patriarchatu Moskiewskiego sformował komisję, która z jego strony ma wziąć udział w dialoguЖурнали засідання Священного Синоду Української Православної Церкви від 24 лютого 2014 року..
W 2018 r. Patriarchat Konstantynopolitański zdjął z niego nałożoną przez Patriarchat Moskiewski anatemę i oświadczył, że Filaret będzie odtąd uznawany za kanonicznego biskupa, żaden z lokalnych Kościołów prawosławnych (w tym polski), nie zaaprobował tej decyzji.
W Kościele Prawosławnym Ukrainy Od 15 grudnia 2018 r. pełnił posługę biskupią w soborze św. Włodzimierza w Kijowie z tytułem honorowego patriarchy Kościoła Prawosławnego Ukrainy. Był też stałym członkiem Synodu tegoż Kościoła.
8 stycznia 2019 r. otrzymał tytuł Bohatera Ukrainy;