W sezonie 2011/2012 Hutnik Nowa Huta występował w IV lidze małopolskiej (zachód) – rozgrywki wygrał i awansował do III ligi grupy VII małopolsko-świętokrzyskiej. Z powodu remontu prowadzonego na stadionie na Suchych Stawach, na wiosnę 2012 swoje mecze rozgrywał na stadionie Grębałowianki. Remont ten miał miejsce z myślą o zbliżających się rozgrywkach Euro 2012. Reprezentacja Anglii wybrała bowiem Suche Stawy jako swoją bazę treningową.
Jesienią 2012 piłkarze powrócili na Stadion Suche Stawy. Przez 4 sezony występowali w III lidze, by w sezonie 2015/16, pomimo zajęcia 10 miejsca, w wyniku reorganizacji III ligi spaść z niej. W sezonie 2017/2018 wywalczyli ponownie awans na czwarty poziom rozgrywek i w sezonie 2019/2020 występowali w III lidze gr. IV.
W sezonie 2019/20, przerwanym przez pandemię COVID-19, drużyna zajęła 2. miejsce. 20 maja 2020 roku komisja ds. nagłych PZPN przyznała awans Hutnikowi do II ligi.
W sezonie 2021/2022 Hutnik zajął 15. miejsce w tabeli II ligi.