Kolor oczu – cecha wielogenowa, zależna przede wszystkim od ilości i typu pigmentów obecnych w tęczówce.
Ludzie i inne zwierzęta mają wiele możliwych fenotypów kolorów oczuMorris, PJ. „Phenotypes and Genotypes for human eye colors.” Athro Limited website. Retrieved May 10, 2006.. U ludzi są one zależne od zmiennych proporcji eumelaniny produkowanej przez melanocyty w tęczówce. Jasno zabarwione oczy wielu gatunków ptaków są w dużej mierze zdeterminowane przez inne pigmenty, takie jak pterydyny, puryny i karotenoidy. Trzy główne elementy w obrębie tęczówki decydują o kolorze oczu: zawartość pigmentów (melaniny) nabłonka tęczówki, zawartość melaniny w zrębie tęczówki i zagęszczenie komórek zrębu tęczówkiHuiqiong Wang, Stephen Lin, Xiaopei Liu, Sing Bing Kang. „Separating Reflections in Human Iris Images for Illumination Estimation.” Proc. IEEE International Conference on Computer Vision, 2005.. Nabłonek tęczówki, oczu wszystkich barw, zawiera pigment eumelaninę. Warianty kolorów wśród różnych tęczówek są zazwyczaj zależne od zawartości melaniny w obrębie zrębu tęczówki.