Jako rezultat kompletnej refaktoryzacji Expression Web dodano kilka nowych właściwości takich jak: elastycznie dostosowywany do potrzeb toolbar oraz menu, diagram standardowych kolorów systemu Windows, walidator pisowni, przerzucanie obiektów pomiędzy stronami na zasadzie drag-and-drop oraz funkcja eksportowania plików z menu. Porównywanie stron na zasadzie datowania czasem zostało usunięte w tej wersji. Wersja 3 wprowadziła narzędzie Expression Web SuperPreview do porównywania i renderowania stron webowych w różnych przeglądarkach. Dodatkowo można było dostrzec brak wsparcia dla relatywnej komunikacji z Web Serwisem za pomocą linków (dla jasności linki takie zaczynały się od „\” np. „\serwis.wsdl”). Funkcjonalność ta została dodana do Expression Studio Service Pack 1.
Wersja Expression Encoder Pro 4, dostępna jako część Expression Studio w programach takich jak DreamSpark, BizSpark, WebsiteSpark nie wspierała standardów oraz kodowania formatu MP4 (H.264 video oraz AAC audio), TS, M2TS, AVCHD, MPEG-2, oraz AC-3 (chociaż po instalacji sterowników DirectShow w wersji 3 reedycja do danych standardów była możliwa za darmo).