W 1939 Nowa Mysz znalazła się pod okupacją sowiecką i stała się częścią BSRR. Od 15 stycznia 1940 r. centrum obwodu baranowickiego. Następnie status osady został zdegradowany do wsi. Od 12 października 1940 roku wieś stała się siedzibą rady wiejskiej o tej samej nazwie.
Od końca czerwca 1941 do 8 lipca 1944 roku wieś była okupowana przez okupantów hitlerowskich, zginęło 6 osób, a 51 domów zostało zniszczonych. Naziści spędzili Żydów ze wsi do getta, a latem 1942 r. wszyscy zostali zamordowani – około 2000 osób. Podczas wyzwalania wsi wyróżnił się dowódca i artylerzysta Michaił Akimow, który zniszczył 5 czołgów wroga, zniszczył 50 okupantów i utrzymał linię do przybycia głównych sił swojego oddziału. Za ten wyczyn Akimow został 25 września 1944 roku odznaczony tytułem Bohatera Związku Radzieckiego.
Podczas okupacji hitlerowskiej, w lipcu 1941 roku Niemcy utworzyli getto dla żydowskich mieszkańców. Przebywało w nim około 800 osób. W czerwcu 1942 roku Niemcy zlikwidowali getto, a Żydów zamordowano. Sprawcami zbrodni było SD z Baranowicz oraz litewski oddział egzekucyjny.
Po wojnie Nowa Mysz weszła w struktury administracyjne Związku Radzieckiego i była siedzibą rejonu nowomyskiego. Od 8 stycznia 1954 w obwodzie brzeskim.