W tym samym roku Nansen otrzymał ofertę pracy od amerykańskiego profesora paleontologii Othniela Charlesa Marsha (1831–1899), którą jednak odrzucił.
Późną zimą 1884 roku samotnie przejechał na nartach z Bergen do Kristianii (i z powrotem), aby wziąć udział w zawodach w skokach narciarskich Husebyrennet. Wrażenia z trasy zrelacjonował w reportażu Paa ski over Fjeldet, który został opublikowany w odcinkach w dzienniku „Aftenposten”.
thumb|Nansen prowadzący obserwacje pod mikroskopem, Muzeum Uniwersyteckie w Bergen, (1887) Jesienią 1885 roku ukończył swoją pierwszą pracę naukową – o krążkokształtnych – Bidrag til Myzostomernes Anatomi og Histologi, która została opublikowana w raporcie rocznym muzeum uniwersytetu w Bergen. W 1886 roku wydał rozprawę Foreløbig Meddelelse om Undersøgelser over Centralnervesystemets histologiske bygning hos Ascidiene samt hos Myxine Glutinosa, traktującą o układzie nerwowym żachw i śluzicy pospolitej, która była pracą przygotowawczą do jego pracy doktorskiej. Prace te były pod wieloma względami pionierskie – zarówno jeśli chodzi o przedmiot zainteresowań naukowych, jak i zastosowane metody badań mikro-anatomicznych komórek nerwowych przy zastosowaniu barwników uwidoczniających połączenia nerwowe pod mikroskopem.