Stefan Koubek (ur. 2 stycznia 1977 w Klagenfurcie) – austriacki tenisista, reprezentant w Pucharze Davisa.
Kariera tenisowa Karierę tenisową rozpoczął w roku 1994. W sezonie 1998 wygrał swój pierwszy turniej rangi ATP Challenger Tour, w niemieckim Alpirsbach. Rok później zwyciężył w rozgrywkach ATP World Tour w Atlancie. W pojedynku finałowym pokonał Francuza Sébastiena Grosjeana. Ponadto w tym samym sezonie osiągnął finał rozgrywek w Bournemouth oraz IV rundę wielkoszlemowego French Open.
Kolejny singlowy tytuł rangi ATP World Tour wywalczył w roku 2000, w Delray Beach, gdzie w meczu finałowym pokonał Álexa Calatravę. W sezonie 2002 ustanowił swój najlepszy wynik wielkoszlemowy - doszedł do ćwierćfinału Australian Open. Mecz o półfinał przegrał z Czechem Jiřím Novákiem.
Trzeci triumf w rozgrywkach ATP World Tour Austriak odniósł w Dosze w roku 2003. Rok później, w tym samym turnieju, osiągnął finał razem z Andym Roddickiem w grze podwójnej. Na początku sezonu 2006 awansował do finału turnieju w Zagrzebiu, jednak w spotkaniu finałowym nie sprostał Ivanowi Ljubičiciowi. W dalszej fazie sezonu wygrał rozgrywki deblowe wspólnie z Philippem Kohlschreiberem w Kitzbühel. W finale pokonali parę Oliver Marach-Cyril Suk.