Szybko okazało się jednak, że nie panują oni nad swoją Ciemną Stroną, ale to ona panuje nad nimi. Ogarnęły ich uczucia chciwości, żądzy władzy, sławy, nienawiść, gniew i strach. Mroczni Jedi – jednym z ich przywódców był Ajunta Pall – podjęli walkę mającą na celu opanowanie galaktyki, a gdy zostali odparci, a ich niedobitki – wygnane z obszarów Republiki, opanowali planety należące do prymitywnej rasy Sithów i przejęli władzę nad ich imperium. Wkrótce zaczęli być nazywani Lordami Sithów, a ich przywódca przyjął tytuł Mrocznego Lorda Sithów. Zaczęli również łączyć tradycyjne dla Jedi sposoby korzystania z Mocy z magicznymi rytuałami rasy Sithów, co stało się na długie tysiąclecia jedną z bardziej charakterystycznych cech ich podejścia do Mocy.
Imperium Sithów Kiedy w okresie około roku 5000 BBY Imperium Sithów zostało odkryte przez zwiadowców Republiki, przeżywało ono okres przez niektórych z nich postrzegany jako stagnacja. Po śmierci Mrocznego Lorda Sithów Marki Ragnosa wybuchł konflikt między jego następcą, lordem Ludo Kresshem a lordem Naga Sadowem, przywódcą frakcji pożądającej ekspansji i podbojów. Konflikt ten doprowadził do wybuchu wielkiej wojny nadprzestrzennej (nie mylić z wojną nadprzestrzenną Starka) między Imperium Sithów a Republiką.