Marcin Nowakowski (ur. 9 listopada 1989 w Kielcach) – polski koszykarz grający na pozycji rozgrywającego, od 2024 zawodnik Enea Abramczyk Astorii Bydgoszcz.
Życiorys Marcin Nowakowski rozpoczynał swoją karierę w 2006 w UMKS Kielce. W tym klubie występował przez 2 lata w II lidze. Od 2008 gra w ekstraklasie w barwach Polonii Warszawa. 19 września 2009 wystąpił wraz z Andrzejem Plutą i Allenem Iversonem w Katowicach w specjalnym konkursie rzutowym zorganizowanym z okazji Mistrzostw Europy organizowanych w PolsceAllen Iverson w Katowicach – Koszykówka – SportoweFakty.pl.. Konkurs polegał na trafieniu do kosza z nietypowych pozycji m.in. na siedząco czy z zamkniętymi oczami. Nowakowski wygrał ten konkurs trafiając czterokrotnie (Iverson trafił 3 razy, natomiast Pluta raz).
12 czerwca 2015 roku podpisał umowę z zespołem King Wilki Morskie Szczecin. 25 stycznia 2016 roku trafił do AZS Koszalin. 1 listopada 2017 został zawodnikiem I-ligowej R8 Basket AZS Politechniki Kraków.
17 czerwca 2019 przedłużył o kolejna dwa lata umowę z Enea Astorią Bydgoszcz. W 2021 roku został zawodnikiem Sokoła Łańcut.