Zbiory Księgozbiór kardynała Furietti liczył 1363 tomów. Liczba woluminów ciągle wzrastała dzięki darowiznom oraz zakupom nowych książek. W 1843 liczyły one 60 tysięcy woluminów. Największy rozrost księgozbioru miał miejsce w XIX wieku. Spowodowało to zamknięcie biblioteki w 1896 roku, na dwa lata, aby uporządkować zbiory. W 1908 roku do zbiorów włączono dokumenty Archiwum miasta. Zostały one w 1976 roku wyodrębnione ze zbiorów jako samodzielny oddział. W momencie ponownych przenosin do Palazzo Nuovo zbiory liczyły 200 000 woluminów. Obecnie biblioteka posiada ok. 700 000 tomów, ponad 11 000 tytułów czasopism, ok. 2150 inkunabułów, znaczną liczbę rycin, autografów, manuskryptów, fotografii oraz innych eksponatów, które czynią z niej jedną z najważniejszych bibliotek historycznych we Włoszech.
Zgodnie z ustawą z 2004 roku biblioteka ma prawo do otrzymywania egzemplarza obowiązkowego druków wydanych na terenie Bergamo i Lombardii.