Edgar Malakian (orm. Էդգար Մալաքյան, ur. 22 września 1990 w Erywaniu) – piłkarz ormiański grający na pozycji pomocnika.
Kariera klubowa Malakian jest wychowankiem klubu Pjunik Erywań. Do kadry pierwszego zespołu awansował w 2007 roku jako 17-latek i w tamtym sezonie zadebiutował w rozgrywkach pierwszej ligi ormiańskiej. Już w debiutanckim sezonie wywalczył z Pjunikiem tytuł mistrza Armenii. W 2008 roku stał się podstawowym zawodnikiem Pjunika. W latach 2008–2010 wywalczył trzy kolejne tytuły mistrzowskie. Wraz z Pjunikiem zdobył też dwa Puchary Armenii w latach 2009 i 2010 oraz superpuchar tego kraju w 2009 roku.
W 2012 roku Malakian przeszedł do Viktorii Pilzno. Zadebiutował w niej 29 lipca 2012 w wygranym 3:0 domowym meczu z FC Hradec Králové. W 2013 roku został najpierw wypożyczony do Dynama Czeskie Budziejowice, a następnie do Bananca Erywań. Latem 2014 został piłkarzem Alaszkertu Erywań. 22 lutego 2016 podpisał kontrakt z ukraińskim klubem Stal DnieprodzierżyńskСталь підписала двох вірменських футболістів - UA-Футбол.