Kariera reprezentacyjna Ito to uczestnik Igrzysk Olimpijskich 1996, podczas których zagrał w 3 spotkaniach: z Brazylią (bramka), Węgrami oraz Nigerią. Pierwszy mecz w reprezentacji seniorskiej zagrał 8 czerwca 1997. Przeciwnikiem była Chorwacja, a mecz zakończył się zwycięstwem Japonii 4:3.
Rok później został powołany na Mistrzostwa Świata. Podczas francuskiego turnieju pełnił rolę zawodnika rezerwowego. Powołany na Copa América 1999, na którym zagrał w trzech meczach z Peru, Paragwajem i Boliwią.
Ostatnim turniejem w drużynie narodowej, na którym Ito zagrał, to Puchar Konfederacji 2001. Wystąpił tam w trzech meczach z Kanadą, Brazylią i Francją. Po raz ostatni w reprezentacji 7 listopada 2001 w zremisowanym 1:1 meczu z Włochami.
Łącznie Ito w latach 1997–2001 zagrał w 28 spotkaniach reprezentacji Japonii.