Nie posiada on natomiast większego znaczenia dla ruchu regionalnego, ponieważ jego sieć obejmuje praktycznie tylko obszar miasta (z wyjątkiem linii S5 sięgającej daleko poza jego granice).
Linie System S-Bahn w Hamburgu składa się z pięciu linii: Linia Trasa S1 Wedel – Rissen – Sülldorf – Iserbrook – Blankenese – Hochkamp – Klein Flottbek – Othmarschen – Bahrenfeld – Ottensen – Altona – Königstraße – Reeperbahn – Landungsbrücken – Stadthausbrücke – Jungfernstieg – Hauptbahnhof – Berliner Tor – Landwehr – Hasselbrook – Wandsbeker Chaussee – Friedrichsberg – Barmbek – Alte Wöhr (Stadtpark) – Rübenkamp – Ohlsdorf – (pierwsze trzy wagony:) – Hamburg Airport(ostatnie trzy wagony:) – Kornweg (Klein Borstel) – Hoheneichen – Wellingsbüttel – Poppenbüttel S2 Diebsteich –– Holstenstraße – Sternschanze – Dammtor – Hauptbahnhof – Berliner Tor – Rothenburgsort – Tiefstack – Billwerder-Moorfleet – Mittlerer Landweg – Allermöhe – Nettelnburg – Bergedorf(pory wieczorne w soboty i niedziele oraz przed dniami wolnymi od pracy:) – Reinbek –Wohltorf – Aumühle(pory wieczorne w soboty i niedziele oraz przed dniami wolnymi od pracy:) Altona – S3 Pinneberg – Thesdorf – Halstenbek – Krupunder – Elbgaustraße – Eidelstedt – Stellingen (Arenen) – Langenfelde – Diebsteich – Altona – Königstraße – Reeperbahn – Landungsbrücken – Stadthausbrücke –