W 1886 Nowak wydzierżawił aptekę w Olicie i wyposażył ją dodatkowo w laboratorium. W 1891 nabył aptekę w rodzinnym Siewierzu (wspólnie ze szwagrem Mechem), kilka lat potem w Radomsku. W 1901 zgłosił chęć pracy w Towarzystwie Lekarskim w Częstochowie, zainicjowanym przez Władysława Biegańskiego, ale do Częstochowy przeniósł się dopiero w 1904. Aptekę założył wspólnie z Feliksem Prüfferem (ojcem wybitnego zoologa Jana Prüffera) i prowadził ją na Starym Rynku w Częstochowie.
Był działaczem stowarzyszeń aptekarskich na ziemiach polskich i inicjatorem szeregu znaczących dla środowiska działań. W 1907 zakładał Koło Właścicieli Aptek Zagłębia Dąbrowskiego i miasta Częstochowy; stanął na jego czele jako prezes. Zasłużył się dla organizacji pozyskaniem lokalu oraz założeniem biblioteki, muzeum i pracowni analitycznej. W 1920 Koło przekształcone zostało w Polskie Powszechne Towarzystwo Farmaceutyczne Okręgu Częstochowskiego, a Nowak nadal stał na jego czele, do 1927, kiedy zrezygnował ze względu na wiek i stan zdrowia. Nadano mu wówczas prezesurę honorową. Wchodził w skład Rady Państwowej Aptekarskiej, zainicjował działalność Hurtowni Właścicieli Aptek w Częstochowie (1916).