Shkodran Mustafi (ur. 17 kwietnia 1992 w Bad Hersfeld) – niemiecki piłkarz występujący na pozycji obrońcy w hiszpańskim klubie Levante oraz w reprezentacji Niemiec. Wychowanek Hamburgera SV, w swojej karierze grał także w takich zespołach jak Everton, Sampdoria, Valencia oraz Arsenal.
Kariera klubowa Mustafi urodził się w niemieckim Bad Hersfeld, pochodzi z albańskiej rodziny, której korzenie sięgały macedońskiego miasta Gostiwar. Swoją karierę piłkarską rozpoczął w juniorskim zespole 1. FC Bebra, skąd następnie trafił do SV Rotenburg. Wreszcie w 2006 roku podpisał kontrakt z Hamburgerem SV.
W maju 2009 roku Mustafi dołączył do angielskiego Evertonu, gdzie włączono go w szeregi piłkarskiej akademii. Z czasem przyznał, że " Na Goodison Park czuje się jak w domu", odrzucając w międzyczasie oferty ze strony Manchesteru City oraz Newcastle United. 16 grudnia 2009 roku Mustafi zadebiutował w barwach pierwszej drużyny, zmieniając Tony'ego Hibberta w 75. minucie przegranego 0:1 meczu Ligi Europy z BATE Borysów. W klubie spędził w sumie nieco ponad dwa lata i jedenastokrotnie zasiadał na ławce rezerwowych podczas meczów Premier League, debiutu się jednak nie doczekał.