31 grudnia krążownik jeszcze był celem nieskutecznego bombardowania przez ciężkie bombowce Avro Lancaster. W styczniu 1945 został wycofany na remont do Niemiec i 14 stycznia został dokowany w Wilhelmshaven. Podczas nalotu amerykańskiego 30 marca dok został uszkodzony i „Köln” osiadł na płytkim dnie, w dalszym ciągu służąc jako bateria lekkiej artylerii przeciwlotniczej wzmacniająca obronę portu. Być może także jego działa 15 cm ostrzeliwały oddziały polskie, które zajęły Wilhelmshaven 6 maja (dywizja generała Maczka)Siegfried Breyer, Die K-Kreuzer (II), Marine-Arsenal Band 13, 1990, .. 5 kwietnia 1945 okręt skreślono z listy floty, a 2 maja dodatkowo wrak uszkodzono materiałami wybuchowymi. Po wojnie okręt złomowano, prace zakończyły się dopiero w 1956.
Dowódcy Kapitän zur See Ludwig von Schröder (15.01.1930-27.09.1932) Kapitän zur See Otto Schniewind (28.09.1932-21.03.1934) Kapitän zur See Werner Fuchs (21.03.1934-30.09.1935) Kapitän zur See Otto Backenköhler (01.10.1935-15.10.1937) Kapitän zur See Theodor Burchardi (15.10.1937-14.01.1940) Kapitän zur See Ernst Kratzenberg (15.01.1940-28.05.1941) Kapitän zur See Friedrich Hüffmeier (29.05.1941-28.03.1942) Korvettenkapitän Hellmuth Strobel (29.03.1942-24.05.1942) Kapitän zur See Martin Baltzer