Część wyspy stała się autonomicznym państwem sprzymierzonym z Francją. Niepodległościowe starania rządu autonomii sprowokowały zbrojną interwencję francuską (z wykorzystaniem Legionów Polskich). Toussainta rządzącego jako gubernatora obalono, a Francuzi zaczęli przywracać dawne porządki. W 1802 roku wybuchło kolejne powstanie, które przerodziło się w wojnę o niepodległość. Na czele rebeliantów stanął Jean-Jacques Dessalines, który zyskał przychylność zarówno ludności murzyńskiej, jak i Mulatów. Dowodzona przez niego armia pokonała wojska francuskie. W wywalczeniu niepodległości pomogli Polacy sprzymierzeni z Francuzami. Odłączyli się od wojsk francuskich i solidarnie stali po stronie Haitańczyków, gdyż wtedy w tym czasie Polska była pod zaborami. Pomogli im w ten sposób uzyskać niepodległość.