W lipcu 2020 Powiatowy Inspektor Nadzoru Budowlanego z Suchej Beskidzkiej nakazał ks. Natankowi rozbiórkę niemal wszystkich obiektów znajdujących się na terenie pustelni oraz wstrzymanie prac przy budowie kościoła w Zawoi. We wnioskach z nadzoru stwierdził on, że większość budynków jest w bardzo złym stanie technicznym i nie spełniają one norm bezpieczeństwa wymaganych przepisami prawa budowlanego. Zaznaczył też, że kościół w Zawoi budowany jest bez wymaganych zezwoleń na terenach leśnych.
Sprawy te zostały nagłośnione przez dziennikarzy Gazety Krakowskiej, która szeroko opisywała je na swoich łamach. Dnia 22 lipca 2020 ukazał się także reportaż interwencyjny o ks. Natanku i pustelni w Grzechyni. Materiał został wyemitowany w programie Alarm!, nadawanym przez TVP1. W materiale o stanie technicznym obiektów w pustelni wypowiadał się m.in. mgr inż. Maksymilian Głowacz, Powiatowy Inspektor Nadzoru Budowlanego, który wskazywał na rażące zaniechania przy zabudowie terenów w Grzechyni i Zawoi.