31 maja 2021 został powołany do 26-osobowego składu na Mistrzostwa Europy 2020. 20 czerwca 2021 roku strzelił dwa gole w 26. i 68. minucie wygranym 3:1 przeciwko Turcji w ostatnim meczu fazy grupowej. 2 lipca w ćwierćfinale strzelił gola na 1:1 przeciwko Hiszpanii, gdzie po dogrywce w serii rzutów karnych Szwajcarzy przegrali 1:3 z Hiszpanią. 15 listopada 2021 Shaqiri został dopiero piątym szwajcarskim zawodnikiem, który rozegrał 100 występów, rozpoczynając ostatnie mecze eliminacyjne do Mistrzostw Świata 2022 wygranym meczu 4:0 przeciwko Bułgarii. 9 listopada 2022 został powołany na Mistrzostwa Świata 2022 w Katarze. 2 grudnia strzelił pierwszego gola wygranym 3:2 meczu z Serbią, przyczyniając się do awansu swojego kraju do fazy pucharowej. 6 grudnia w meczu 1/8 finału rozegrał całe spotkanie, gdzie Szwajcaria odpadła przegrywając 1:6 z Portugalią. 7 czerwca 2024 został powołany do 26-osobowego składu na Mistrzostwa Europy 2024 w Niemczech. 19 czerwca w drugim meczu grupowym strzelił gola dający remis 1:1 ze Szkocją, stając się pierwszym zawodnikiem, który strzelił gola w rozgrywkach, grając w klubie z Ameryki Północnej lub Południowej. Jest także pierwszym zawodnikiem, który strzelił gola w ostatnich sześciu głównych międzynarodowych mistrzostwach (Mundial '14, Euro '16, Mundial '18, Euro '20, Mundial '22 i Euro '24).