W latach 60. XX wieku Clement Zablocki jako kongresmen wsparł inicjatywę architekta polskiego pochodzenia Władysława Poray-Biernackiego, który od lat zabiegał o to, by w Krakowie wybudowano nowoczesny szpital dziecięcy. Powołano do życia komitet The American Research Hospital in Poland, który prowadził zbiórkę funduszy, a Kongres Stanów Zjednoczonych zatwierdził specjalną dotację na ten cel. Wsparcie rządu amerykańskiego było kontynuowane prze wiele lat. Dzięki zaangażowaniu Zablockiego stało się możliwe otwarcie w 1965 roku, a w kolejnych latach rozwój Instytutu Pediatrii w Krakowie – Prokocimiu
Zabłocki został pochowany na cmentarzu św. Wojciecha w Milwaukee.
Upamiętnienie Jego imię nosi Clement J. Zablocki Veterans Affairs Medical Center przy 5000 West National Avenue w Milwaukee, podobnie jak Biblioteka Zabłockiego i Szkoła Podstawowa im. Clementa J. Zablockiego w Milwaukee. W 1993 roku powstało Centrum Ambulatoryjne Leczenia Dzieci Polsko-Amerykańskiego Instytutu Pediatrii Collegium Medicum Uniwersytetu Jagiellońskiego (nazwa od 1993 roku do 1997), któremu nadano imię Clementa J.