Od 1999 ponownie był zawodnikiem klubu z Sanoka pod nazwą SKH. Po sezonie 2000/2001 przeszedł do GKS Tychy.
W latach 1992–2010 Marcin Ćwikła rozegrał 18 sezonów w polskiej lidze hokejowej, w sumie 589 meczów, strzelając w nich 174 gole i uzyskując 132 asysty. Na ławce kar spędził 706 minut.
Po zakończeniu sezonu 2009/2010 w barwach sanockiego klubu przerwał karierę. 8 września 2010 poinformował o zakończeniu kariery zawodniczej. Po zakończeniu profesjonalnej kariery zawodniczej podjął występy w półamatorskich rozgrywkach II ligi edycji 2013/2014, 2014/2015 w barwach drużyny LHT Lublin.
Kariera reprezentacyjna W wieku juniorskim występował w reprezentacjach Polski do lat 16, do lat 17 (1989), do lat 18 (1989), do lat 20 (1991). Uczestniczył w turniejach mistrzostw Europy juniorów do lat 18 w 1991 oraz mistrzostw świata juniorów do lat 20 grupy B w 1992. Został kadrowiczem seniorskiej kadry Polski. Łącznie w dorosłej kadrze kraju rozegrał 14 spotkań, w których zdobył jednego gola.
Wykształcenie, działalność szkoleniowa i inna Ukończył liceum ogólnokształcące i Szkołę Medyczną w Sanoku na kierunku ratownik medyczny. Podjął studia na Uniwersytecie Rzeszowskim.