W okresie od 26 sierpnia do 29 grudnia 1988 dywizja po raz pierwszy w historii Wojsk Rakietowych Przeznaczenia Strategicznego pod kontrolą grup inspekcyjnych USA przeprowadziła 36 startów rakiet RSD-10 "Pionier" - w celu ich likwidacji. W latach 1992–1994 w związku z układem o ograniczeniu zbrojeń strategicznych – ze składu dywizji Harbińskiej wycofane zostały trzy kolejne pułki rakietowe.
W 1995 na uzbrojenie dywizji przekazano nowy typ rakiet międzykontynentalnych – RT-2PM „Topol”. W składzie dywizji były wówczas dwa pułki z 18 stanowiskami startowymi.
Na podstawie dyrektywy I zastępcy ministra obrony Federacji Rosyjskiej nr 314/3/0839 z 14 listopada 2001 rozpoczęto przygotowania do rozformowania i likwidacji 4 Harbińskiej Dywizji Rakietowej. Ostatecznie dywizję rozformowano w październiku 2002. Obiekty infrastruktury przekazano wojskom Syberyjskiego Okręgu Wojskowego.