Izrael oskarżył IHH o posiadanie bliskich związków z Hamasem i sympatyzowanie z Al-Ka’idą.
„Pokojowa Flotylla” Flotylla składała się ze statków posiadanych lub wynajętych przez kilka organizacji pozarządowych, włączając w to Ruch Wolna Gaza, turecką IHH oraz grecki „Statek do Gazy”. Główną jednostką był turecki statek MV „Mavi Marmara”, przewożący ponad 500 aktywistów.
Statki wchodzące w skład „Pokojowej Flotylli” podczas incydentu z 31 maja 2010: „Challenger I” – statek Ruchu Wolna Gaza. „Eleftheri Mesogeios” (gr. Eλεύθερη Mεσόγειος, Wolne Morze Śródziemne) – statek towarowy pod banderą grecką. Statek szwedzko-greckiej organizacji „Statek do Gazy”, znany także pod nazwą MS Sofia. „Sfendoni” (gr. Σφενδόνη, Proca) – statek pasażerski pod grecką banderą, sterowany przez członków organizacji „Statek do Gazy” oraz Europejskiej Kampanii na rzecz Zakończenia Oblężenia Gazy. Obie greckie jednostki opuściły Pireus 25 maja, dołączając do reszty statków u wybrzeży Cypru. MV „Mavi Marmara” – turecki statek pod banderą Komorów, który był przedtem własnością firmy Istanbul Fast Ferries Co. Inc. i kursował po Morzu Marmara. Został zakupiony przez IHH specjalnie dla odbycia kursu do Strefy Gazy. Statek opuścił port w Antalyi 22 maja, dołączając do jednostek „Gazze” i „Defne Y”.