Trzecim przedstawicielem Kazachstanu w Lidze Europejskiej został więc zespół Okżetpes KokczetawОкжетпес примет участие в Лиге Европы ..
2 października 2008 KFF podejmował decyzję w sprawie zespołów Szachtior Karaganda i Wostok Öskemen w sprawie ustawiania meczów przez te kluby. Szachtior Karaganda został ukarany 9 pkt ujemnymi, a Wostok Öskemen został wykluczony z rozgrywek. Wszystkie mecze z udziałem zespołu Wostok Öskemen zostały anulowane.
Kajrat Ałmaty został ukarany 3 pkt ujemnymi za niespłacanie długów w terminie.
20 stycznia 2009 Kajrat Ałmaty wysłał list do KFF, w którym dobrowolnie rezygnuje z udziału w rozgrywkach Priemjer-Ligi w 2009.
Zespół FK Astana został ukarany 3 pkt ujemymi. za niespłacenie transferów z klubów Okżetpes Kokczetaw i FK Ałmaty. 20 stycznia 2009 drużyna FK Astana zrezygnowała z udziału w rozgrywkach Priemjer-Ligi w 2009 z powodu niespłaconego długuAstana fall short of Kazakh requirements ..
16 listopada 2008 KFF zdecydował o nie zmienianiu formatu rozgrywek w sezonie 2009, co oznaczało, że będzie występować 16 zespołów.