Dziś w budynkach opactwa mieści się administracja prowincji i Muzeum Zelandii.
W 1217 Middelburg otrzymał prawa miejskie od hrabiego Willema I i hrabiny Johanny z Flandrii.
W XV w. ujście rzeki Sloe na wschód od miasta było nadal żeglowne, co pozwoliło Middelburgowi rozwinąć się w dobrze prosperujące miasto handlowe, które niekiedy było nawet najważniejsze w kraju zaraz po Amsterdamie.
Późnogotycki ratusz w centrum miasta, zbudowany w 1452, jest jednym z najważniejszych zabytków w całej Zelandii, a nawet w całej Holandii. W 1607 cech strzelecki wystawił swój okazały budynek Kloveniersdoelen.
W holenderskiej wojnie o niepodległość w 1572 Middelburg stanął po stronie królestwa hiszpańskiego. Cristóbal de Mondragón przeniósł się do Middelburga ze swoimi oddziałami, by bronić miasta. W 1573 Middelburg został otoczony przez wojska Wilhelma Orańskiego, po czym nastąpiło długie oblężenie. 21 lutego 1574 nastąpiło poddanie się miasta i Cristóbala de Mondragóna wraz z jego wojskami – dzięki ich dzielnej obronie na honorowych warunkach. W ten sposób Middelburg został włączony do Republiki Zjednoczonych ProwincjiRaymond Fagel: Protagonists of War: Spanish Army Commanders and the Revolt in the Low Countries. Leuven University Press, Leuven 2021, S.