25 lutego 1992 Synod Rosyjskiego Kościoła Prawosławnego nadał mu godność metropolity, zaś w roku następnym ponownie skierował do eparchii rostowskiej i nowoczerkaskiej. 27 grudnia 1995 metropolita Włodzimierz został metropolitą petersburskim i ładoskim, co łączy się z honorowym członkostwem w Świętym Synodzie. Był również tytularnym proboszczem parafii przy soborze Włodzimierskiej Ikony Matki Bożej w Petersburgu.
Początkowo zdecydowany zwolennik ekumenizmu, po konflikcie z częścią duchowieństwa petersburskiego odnoszącego się do tej idei negatywnie, zmienił swoje stanowisko na bardziej sceptyczne.
W 2014 odszedł w stan spoczynku z uwagi na wiek. Jako miejsce jego pobytu wyznaczono Ławrę św. Aleksandra Newskiego w Petersburgu. Metropolita zachował także godność honorowego proboszcza soboru Włodzimierskiej Ikony Matki BożejУдовлетворено прошение митрополита Санкт-Петербургского Владимира о почислении на покой. Zmarł w 2022 i został pochowany na Cmentarzu Mikołajewskim w Ławrze Aleksandra Newskiego w Petersburgu.
Odznaczenia mały|200px|Włodzimierz (Kotlarow) jako arcybiskup krasnodarski z metropolitą warszawskim i całej Polski Bazylim mały|200px|Metropolita Włodzimierz w czasie wizyty patriarchy konstantynopolitańskiego Bartłomieja w Petersburgu.