Niemniej flaga na maszcie przed parlamentem pojawiła się jeszcze w latach 30.
Po rozpoczęciu 9 kwietnia 1940 niemieckiej okupacji Danii, Wyspy Owcze zostały zajęte przez wojska brytyjskie w ramach pokojowej okupacji. Z tego też powodu używanie duńskiej bandery przez zawijające do alianckich portów farerskie jednostki nie było rozwiązaniem możliwym do utrzymania. W wyniku rozmów trójstronnych prowadzonych pomiędzy dowództwem brytyjskim, duńskim prefektem oraz farerskim parlamentem, a także przy udziale Foreign Office i duńskiej ambasady w Londynie, 25 kwietnia 1940 rząd brytyjski uznał Merkið za oficjalną banderę cywilną Wysp Owczych. W czasie wojny zdecydowano się na usunięcie masztu przed parlamentem i zastąpienie duńskiej flagi na samym budynku Løgtingu flagą Wysp.
Oficjalny charakter w ramach królestwa Danii flaga otrzymała 25 sierpnia 1948 r. na mocy królewskiego aktu autonomii. W 1949 na pamiątkę wydarzeń z 1940 roku Løgting ustanowił 25 kwietnia świętem państwowym pod nazwą Flaggdagur („dzień flagi”). Ustawa o fladze precyzująca jej konstrukcję, kolorystykę i zasady prawidłowego użycia została przyjęta 17 lipca 1959 r.