Drugi gracz może podłączyć lub odłączyć się od gry w każdej chwili – w momencie odłączenie, sterowanie drugiego gracza przejmuje komputer.
Batman oraz Robin mają odmienne umiejętności, co wymaga podczas gry współpracy dwóch graczy (lub gracza i komputera) w celu ukończenia danego poziomu; analogicznie jest w przypadku wykonywania misji jako złoczyńca.
Poza trybem fabularnym dostępny jest również tryb swobodny, („free play”) w którym gracz może powtórzyć dany poziom z możliwością zmiany postaci którą kieruje w trakcie gry i dzięki temu otrzymuje dostęp do pomieszczeń, które nie były dostępne w trybie fabularnym (w trybie fabularnym gracz steruje z góry narzuconym bohaterem i nie może dostać się w miejsca, które wymagają posiadania umiejętności, którymi dysponuje inna postać, niż ta, którą w danej chwili on kieruje).
Podczas niektórych misji, gracz nie kieruje bezpośrednio postacią, a pojazdem w którym się ona znajduje. W grze dostępne są samochody, łodzie, śmigłowce oraz samoloty.
Wyboru misji dokonuje się będąc w Batjaskini (walcząc po stronie Batmana) lub w Azylu Arkham (walcząc po stronie jego przeciwników);