Pierwszy pociąg przez Pomorzany przejechał 15 sierpnia 1843, kiedy połączono Berlin ze Szczecinem. Kolejna linia kolejowa zbudowana została w 1898, połączyła ona Szczecin Główny z Policami przez stację Szczecin Pomorzany (niem. Stettin-Pommerensdorf), w 1910 została wydłużona do Trzebieży Szczecińskiej, zamknięta 1 października 2002. W 1899 otwarta została wąskotorowa linia do Casekow, stacja Pommerensdorf Kleinbahnhof była jej końcową, została rozebrana w 1945 przecięta granicą państwową. W 1931 powstała kolejna linia, odnoga linii Szczecin Główny – Szczecin Gumieńce przez nieczynną w ruchu pasażerskim stację Szczecin Wzgórze Hetmańskie (istnieje tam także Lokomotywownia EZT). Ostatnia linia połączyła 5 lat później Szczecin z Dąbiem przez południowe Międzyodrze. W ten sposób Pomorzany stały się jedną z większych stacji węzłowych w Szczecinie.