Wreszcie w okolicy dworca kolejowego, załadowano aresztowanych na ciężarówki i wywieziono do prowizorycznego więzienia utworzonego na terenie dawnych polskich koszar wojskowych w Tczewie. Tam wyczerpanych księży umieszczono w piwnicach, gdzie Niemcy znęcali się nad nimi przez długi czas. Jeszcze tego samego wieczoru niezidentyfikowany pluton egzekucyjny rozstrzelał na terenie koszar szesnastu spośród dziewiętnastu aresztowanych księży pelplińskich. Wśród zamordowanych znaleźli się m.in.: ks. Juliusz Bartkowski (infułat, były proboszcz pelpliński); ks. Paweł Kirstein (dyrektor Collegium Marianum); ks. Alojzy Lewandowski (szambelan papieski, proboszcz pelplińskiej parafii); ks. Bolesław Partyka (kanonik, wizytator szkół średnich); ks. Józef Roskwitalski (rektor Wyższego Seminarium Duchownego); ks. Walter Schütt (kanclerz Kurii Diecezjalnej).