Poza zwykłymi zagadkami, przyjaciele mają również do rozwiązania inną tajemnicę: przed laty w Kryształowym Zdroju zaginęło czworo nastoletnich detektywów, zwanych Brygadą Detektywów, którzy dziwnym trafem przypominają nową czwórkę (mieli oni także gadającego zwierzaka – papugę, Peryklesa). Na trop zaginionych bohaterowie wpadają dzięki tajemniczemu panu E, który podrzuca im kolejne wskazówki.
Bohaterowie W porównaniu do poprzednich serii, nastąpiły zmiany w charakterach i wyglądzie głównych postaci. Daphne jest zakochana we Fredzie, który przez swoją obsesję na punkcie pułapek nie zdaje sobie sprawy ani z jej, ani ze swoich własnych uczuć. Velma stała się nie tylko bardziej cyniczna, ale także zaczęła bardziej dbać o swój wygląd (kokardy we włosach oraz tusz na rzęsach). Ponadto potajemnie spotyka się z Kudłatym, który rozdarty jest pomiędzy swoimi uczuciami do niej a przyjaźnią ze Scoobym.