W 2. połowa 1984 do października 1989 batalionowi WOP Prudnik podlegały: Strażnica WOP Lądowa rozwinięta kat. II w Pomorzowicach Strażnica WOP Lądowa rozwinięta kat. II w Krzyżkowicach Strażnica WOP Lądowa rozwinięta kat. I w Pokrzywnej Strażnica WOP Lądowa rozwinięta kat. I w Konradowie Strażnica WOP Lądowa rozwinięta kat. I w Gierałcicach Strażnica WOP Lądowa rozwinięta kat. II w Jasienicy Górnej Strażnica WOP Lądowa rozwinięta kat. II w Gościcach Grupa Operacyjno-Rozpoznawcza Zwiadu w Nysie.
Dowództwo batalionu październik 1989: dowódca batalionu – ppłk Aleksander Klimas szef sztabu batalionu – kpt. Józef Kulak zastępca dowódcy batalionu do spraw politycznych – kpt. Wojciech Wróbel 22px|alt=ppłk SG Wojciech Wróbel zastępca dowódcy batalionu do spraw zwiadu – mjr Lech Klimko zastępca dowódcy batalionu do spraw technicznych i zaopatrzenia – mjr Waldemar Jakubek.