Projekt Całością prac nad nowym samolotem kierował główny inżynier firmy Nakajima, Kenichi Matsumura wspomagany przez inżyniera Kazuo Ohno. Wstępny projekt konstrukcyjny opierał się na układzie zastosowanym w niemieckim myśliwcu Messerschmitt Me 262, z którym Japończycy mieli możliwość zapoznać się w 1943 roku, na specjalnie dla nich zaplanowanym pokazie. Orędownikiem takiego rozwiązania był komandor Eiichi Iwaya, który przywiózł do Japonii część dokumentacji technicznej Me 262 udostępnionej przez Niemców. Po zaakceptowaniu wstępnego projektu przez Wydział Techniczny Dowództwa Lotnictwa Marynarki Wojennej, doprecyzowano charakterystykę techniczną nowego samolotu. Plany wobec nowej konstrukcji były bardzo ambitne. Do końca października 1944 zakładano ukończenie kompletnej dokumentacji technicznej, do końca listopada tego samego roku zakończone miały być próby z nowym silnikiem TR-12B (Ne-12B), a z końcem 1944 roku miało być gotowych pierwszych czterdzieści egzemplarzy samolotu. 8 grudnia 1944 roku dyrektor techniczny Nakajimy, inżynier Kazuo Yoshida zaprezentował przedstawicielom lotnictwa marynarki gotową drewnianą makietę nowego samolotu naturalnej wielkości. Dzień później, 9 grudnia plany marynarki wobec nowej konstrukcji uległy radykalnej zmianie.