W konsekwencji nie było możliwości zastosowania dotychczasowego hierarchicznego schematu łączenia w jednej NTS poziomów administracyjnych i statystycznych (od przystąpienia Polski do Unii Europejskiej zmiany na poziomie regionalnym – NTS 1, NTS 2, NTS 3 – mogły następować jedynie równolegle z analogiczną zmianą wprowadzaną odpowiednim rozporządzeniem Komisji UE dotyczącym zmian w NUTS).
Poziomy Jednostki NTS wydzielone były na 5 poziomach, z czego poziomy 1–3 były poziomami regionalnymi, a poziomy 4–5 – lokalnymi. Każda jednostka posiadała symbolzgodnie z załącznikiem do rozporządzenia w sprawie wprowadzenia NTS.
Numer poziomu Struktura symbolu Nazwa jednostek poziomu Liczba jednostek (stan na 01.01.2015 r.) 1 X.X regiony 6 2 X.X.XX województwa 16 3 X.X.XX.XX podregiony 72 4 X.X.XX.XX.XX powiaty (wraz z miastami na prawach powiatu) 380 5 X.X.XX.XX.XX.XX.X gminy i ich części 3737 Pierwsza cyfra symbolu oznaczała numer poziomu, druga – numer regionu, trzecia i czwarta – numer województwa (identyczna z dwucyfrowym symbolem województwa w TERYT), piąta i szósta – numer podregionu, siódma i ósma – numer powiatu (identyczna z dwucyfrowym symbolem powiatu w TERYT), dziewiąta, dziesiąta i jedenasta – numer gminy (identyczna z trzycyfrowym symbolem gminy w TERYT), np.