W roku 1940 władze aresztowały kilkunastu głosicieli i pionierów, których bezskutecznie zmuszano do wyrzeczenia się wiary. Do roku 1942 byli więzieni lub trzymano ich w aresztach domowych. We wrześniu 1942 roku w Hotelu Terminaus w São Paulo zorganizowano kongres pod hasłem „Nowy świat”, uczestniczyło w nim 721 osób, a 10 zostało ochrzczonych. W roku 1943 w Porto Alegre odbył się kongres pod hasłem „Wolny naród” z udziałem 50 osób, kongresy odbyły się również w miastach São Paulo, Salvador, Manaus, Rio de Janeiro i w Kurytybie.
Rozwój działalności W roku 1945 przysłano pierwszych misjonarzy z pierwszej klasy Szkoły Gilead. 13 października 1945 roku tamtejsi głosiciele puścili w obieg petycję z prośbą o poparcie prawnej rejestracji Świadków Jehowy. W całym kraju około 400 głosicieli zebrało 44 411 podpisów. Wysłano ją do pałacu prezydenckiego, ale nie otrzymano żadnej odpowiedzi. W tym samym roku Nathan H. Knorr i Frederick W. Franz brali udział w programie kongresu w São Paulo.