Wybrane prace Zagadnienie uczucia. Kraków: Gebethner, 1911. Wzruszenia u schizofreników. Rocznik Psychjatryczny 5, s. 95–103, 1927. Konstytucja i charakter Rocznik Psychjatryczny 20, s. 66–74, 1933. Cyklotymja w atypowej postaci. Rocznik Psychjatryczny 21, s. 379–386, 1933. Rola konstytucji w zaburzeniach psychicznych reaktywnych. Rocznik Psychjatryczny 23, s. 1–8, 1934. Nerwice a układ wegetatywny. Polska Gazeta Lekarska, 1936. Psychozy pomroczne odwykowe. Przyczynek do kliniki omamów. Rocznik Psychjatryczny 34/35, s. 81–88, 1938.
Upamiętnienie W ramach akcji „Katyń... pamiętamy” / „Katyń... Ocalić od zapomnienia”, podpułkownik Marcin Zieliński został uhonorowany poprzez zasadzenie Dębu Pamięci w Parku im. Henryka Jordana w Krakowie.
Marcinowi Zielińskiemu został poświęcony jeden z odcinków filmowego cyklu dokumentalnego pt.