Nikomu nic się nie stałoOpis wypadku na Aviation Safety Network..
8 czerwca 1997, podczas lotu z Hongkongu do Nagoi, McDonnellem Douglasem MD-11 (JA8580) załoga zbyt gwałtownie obniżała wysokość, w wyniku czego rannych zostało pięciu pasażerów i siedmiu członków załogi (jeden zmarł 20 miesięcy później).
2000- 31 stycznia 2001, w wyniku błędu kontroli lotów, dwa samoloty Japan Airlines prawie zderzyły się w powietrzu – Boeing 747-446D (JA8904) i McDonnell Douglas DC-10 (JA8546). W wyniku wypadku rannych zostało 99 osób (w tym 9 ciężko). Łącznie w obu maszynach znajdowało się 677 pasażerów i członków załógASN Aircraft accident McDonnell Douglas DC-10-40 JA8546 off Shizuoka Prefecture.ASN Aircraft accident Boeing 747-446D JA8904 off Shizuoka Prefecture..
3 kwietnia 2007 po starcie z Tokio w Boeingu 777 przegrzał się silnik nr 2, kiedy samolot znajdował się na wysokości 8500 m. Załoga zdołała bezpiecznie wylądować w Fukuoka.