Pochowany został w Würzburgu, w którym zginął i chrystianizował pogan.
Kult 8 lipca 752 roku bp Burchard (późniejszy święty) dokonał elewacji relikwii, prawdopodobnie z inicjatywy św. Bonifacego-Winfrida, który założył diecezję w mieście w 741 roku.
W 788 roku, w obecności Karola Wielkiego, grób Kiliana przekształcono w katedrę, wybudowano kolejny budynek (Kolegiata Neumünster), który jest obecnym miejscem spoczynku Świętego oraz świętych: Kolonata i Totnana. Do chwili obecnej odbywają się do tego miejsca pielgrzymki m.in. z terenów pracy misyjnej w Saksonii.
Rozpowszechnienie kultu św. Kiliana w Irlandii, nastąpiło nie później niż pod koniec IX wieku.
Patronat Jest patronem Frankonii, miast: Würzburga, Heilbronnu, diecezji: würzburskiej i erfurckiej oraz drugim patronem diecezji paderborńskiej oraz osób cierpiących na reumatyzm, dnę moczanową i choroby oczu.
Dzień obchodów Wspomnienie liturgiczne w Kościele katolickim i ewangelickim obchodzone jest 8 lipca, na pamiątkę podniesienia relikwii.