Latem 2012 Hernández został zawodnikiem klubu CF Pachuca, gdzie od razu został kluczowym zawodnikiem środka pola. W wiosennym sezonie Clausura 2014 zdobył ze swoim zespołem tytuł wicemistrza kraju, zaś dwa lata później – podczas rozgrywek Clausura 2016 – wywalczył pierwsze w swojej karierze mistrzostwo Meksyku. W taktyce trenera Diego Alonso miał wówczas niepodważalną pozycję w jedenastce, tworząc duet środkowych pomocników z Erickiem Gutiérrezem. W tym samym roku zajął również drugie miejsce w krajowym superpucharze – Campeón de Campeones.
Kariera reprezentacyjna W 2011 roku Hernández został powołany przez Luisa Fernando Tenę do rezerwowej reprezentacji Meksyku, złożonej głównie z graczy z rocznika '89, która pod szyldem dorosłej kadry wzięła udział w Copa América. Zaledwie kilka dni przed rozpoczęciem turnieju, podczas zgrupowania w Ekwadorze, razem z siedmioma innymi zawodnikami naruszył wewnętrzne zasady drużyny, wskutek czego został natychmiast wydalony z zespołu narodowego, zawieszony na pół roku w prawach reprezentanta, a także ukarany grzywną. Po odbyciu dyskwalifikacji, w maju 2012, znalazł się w ogłoszonym przez Tenę składzie reprezentacji Meksyku U-23 na prestiżowy towarzyski Turniej w Tulonie.