Od 1987 był archimandrytą.
Biskup W 1990 arcybiskup penzeński Serafin polecił jego kandydaturę na pierwszego ordynariusza nowo tworzonej eparchii sarańskiej i mordowskiej. Została ona przyjęta przez patriarchę moskiewskiego i całej Rusi Aleksego II. 8 lutego 1991 miała miejsce chirotonia archimandryty Warsonofiusza na biskupa sarańskiego i mordowskiego. Na terenie eparchii biskup założył w ciągu kolejnych lat ponad 200 parafii i założył bądź reaktywował 14 monasterów. W lutym 2001 został podniesiony do godności arcybiskupiej.
W 2009 r. została mu powierzona funkcja kanclerza Patriarchatu Moskiewskiego (dosł. zarządzającego sprawami) będąc tym samym stałym członkiem Świętego Synodu Rosyjskiego Kościoła Prawosławnego. 1 lutego 2010 otrzymał godność metropolity.
Od maja 2011 do października 2011В праздник Покрова Пресвятой Богородицы Предстоятель Русской Церкви совершил Литургию в соборе Христа Спасителя г.