Wprowadzono także system manualnego przełączania biegów Saab Sentronic przy pomocy przycisków w kole kierownicy, który jest wyposażenie standardowym wszystkich wersji samochodu z 5-biegową automatyczną skrzynią biegów z wyjątkiem wersji z silnikiem wysokoprężnym 2.2 TiD.
W 2003 roku podczas targów motoryzacyjnych we Frankfurcie zaprezentowano model na rok 2004. Auto otrzymało zmiany stylizacyjne najdroższych w gamie wersji 9-5 Aero (zderzaki, czarny matowy grill, inaczej wyprofilowano progi drzwi oraz zastosowano 17-calowe aluminiowe felgi), wprowadzono nowy turbodoładowany silnik benzynowy o pojemności 2.3 l i mocy 220 KM do odmian Linear, Arc oraz Vector; a także zastosowano nowy wystrój wnętrza oraz dodano do wyposażenia funkcję przypominającą o zapięciu pasów bezpieczeństwa.
Od 1997 do 2010 roku wyprodukowano łącznie 483 593 egzemplarze pierwszej generacji pojazdu.
Drugi lifting 9-5 I po liftingu został zaprezentowany podczas targów motoryzacyjnych we Frankfurcie w 2005 roku.