Relatywnie najmniej szkód wywołują ibuprofen i nabumeton. Rzadsze przyczyny: zespół Zollingera-Ellisona choroba Leśniowskiego-Crohna kortykosteroidy Wywierają działanie wrzodotwórcze w skojarzeniu z niesteroidowymi lekami przeciwzapalnymi (jednoczesne podawanie leków z obu grup zwiększa ryzyko powstania wrzodu 15-krotnie; same NLPZ zwiększają to ryzyko 4-krotnie). nadczynność przytarczyc mastocytoza układowa zespół rakowiaka bazofilia w zespołach mieloproliferacyjnych przerost komórek G w części przedodźwiernikowej żołądka zakażenie wirusem opryszczki pospolitej i cytomegalowirusem zakażenie Helicobacter heilmannii leki chlorek potasu bisfosfoniany mykofenolan mofetylu zwężenie dwunastnicy napromienianie chemioterapia sarkoidoza przyczyny idiopatyczne
Nie udowodniono wpływu alkoholu etylowego, sposobu odżywiania, roli stresu ani czynników psychologicznych w powstawaniu choroby wrzodowej. Mogą jednak zaostrzać jej przebieg.
Choroba wrzodowa żołądka i dwunastnicy może być objawem klinicznym depresji maskowanej (to jest takiego rodzaju depresji, w którym endogenny zespół depresyjny maskowany jest przez inne objawy).