W wyniku tego, scenarzysta Tom Mankiewicz solidaryzujący się z Donnerem i montażysta Stuart Baird zrezygnowali z projektu, a Gene Hackman odmówił udziału w dokrętkach autorstwa Lestera, co ograniczyło liczbę scen w jakich się pojawia w ostatecznej wersji filmu.
Do materiału nakręconego przez Donnera należą: wszystkie sceny z Gene’em Hackmanem, sceny na Księżycu, sceny w Białym Domu, scena starcia Clarka z Rockym oraz duża część materiału przedstawiające przybycie trójki kryptońskich przestępców do redakcji Daily Planet. Ponieważ pomiędzy produkcją materiału Donnera a Lestera minęły 2 lata, to wygląd Margot Kidder i Christophera Reeve’a zdążył się zmienić. Reeve w scenach nakręconych przez Donnera jest mniej umięśniony niż w scenach nakręconych przez Lestera. Z kolei sposób uczesania Kidder, jej kolor włosów i make-up są w filmie różnie zależnie czy sceny były kręcone przez Donnera czy przez Lestera.
W celu uniknięcia płacenia Marlonowi Brando wysokiego wynagrodzenia, usunięto wszystkie sceny z jego udziałem.
W oryginalnym scenariuszu, to detonacja pocisku nuklearnego, który Superman powstrzymał w pierwszej części, spowodowała uwolnienie się kryptońskich przestępców z Phantom Zone.