Pusty kościół wizytator biskupi polecił miejscowemu proboszczowi otoczyć kościół opieką, przez co powstało wrażenie, jakoby świątynia należała do parafii.
Jan Albracht zmarł w 1650, nie mógł dwa lata później fundować późniejszego kościoła klasztornego. Przypisuje się jemu wzniesienie na terenie miasta kościoła parafialnego, kaplicy pod wezwaniem św. Antoniego Padewskiego i szpitalaGołańcz – z dziejów..., s. 54; Sławomir Leitgebert, Smoguleccy herbu Grzymała. Dzieje rodziny od XVI do XVIII wieku, „Genealogia. Studia i Materiały Historyczne”, t. 6, 1996, s. 36.. Szpital przypisywany Smoguleckiemu istniał już wcześniej. Historycy sztuki uważają, iż murowana świątynia szpitalna o czteroprzęsłowej nawie powstała w XV-XVI wiekuKatalog zabytków sztuki w Polsce, t. 5, Województwo poznańskie, z. 27, Powiat wągrowiecki, Warszawa 1964, s. 5., a sam szpital funkcjonował na przełomie XVI i XVII wiekuWojciech Osuch, Dziedzice Gołańczy..., s. 15.. Zapewne kościół szpitalny w okresie najazdu szwedzkiego został spustoszony i był nieużywany przez kilkadziesiąt lat.