Latem 1999 roku Sánchez wrócił do zespołu Valencii. W 2000 roku awansował z Valencią do finału Ligi Mistrzów, jednak nie wystąpił w nim, a Valencia uległa 0:3 Realowi Madryt. Z kolei w 2001 roku zagrał w finale Ligi Mistrzów z Bayernem Monachium, a Valencia przegrała po serii rzutów karnych. W sezonie 2001/2002 wywalczył mistrzostwo kraju, a w sezonie 2003/2004 powtórzył ten sukces. W 2004 roku zdobył też Puchar UEFA.
W 2004 roku Sánchez odszedł z Valencii i po raz drugi w karierze został piłkarzem Celty Vigo. W 2005 roku awansował z nią z Segunda do Primera División. W 2006 roku zakończył karierę.
Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 1991/92 Valencia CF B
Tercera División ? ? 1992/93 Valencia CF
Primera División 17 3 1992/93 Valencia CF B
Segunda División B ? ? 1993/94 RCD Mallorca
Segunda División 37 16 1994/95 Celta Vigo
Primera División 23 2 1995/96 Celta Vigo
Primera División 37 10 1996/97 Celta Vigo
Primera División 32 4 1997/98 Celta Vigo
Primera División 31 9 1998/99 Celta Vigo
Primera División 36 13 1999/00 Valencia CF
Primera División 31 5 2000/01 Valencia CF
Primera División 32 12 2001/02 Valencia CF
Primera División 24 4 2002/03 Valencia CF
Primera División 26 5 2003/04 Valencia CF
Primera División 10 1 2004/05