Wobec kontuzji podstawowego napastnika Santos Laguny, Christiana Beníteza, Quintero rozpoczął sezon na pozycji wysuniętego napastnika. Na początku rozgrywek Quintero, podobnie jak inni napastnicy Santos Laguny, był krytykowany za nieskuteczność, jednak chwalono go również za zaangażowanie i agresywność na boisku. Po powrocie Beníteza do zdrowia zaczął pełnić rolę cofniętego atakującego, tworząc z Ekwadorczykiem dobrze uzupełniający się na boisku duet. Pierwszego gola w Meksyku Kolumbijczyk zdobył 15 lutego 2009 w meczu z Guadalajarą, w 60. minucie strzałem głową podwyższając prowadzenie swojego zespołu na 2:0 (ostateczny wynik meczu to 2:1). W swoim debiutanckim sezonie w Meksyku, Clausura 2009, wpisywał się na listę strzelców jeszcze trzykrotnie – strzelił dwa gole w zremisowanym 2:2 meczu z Tolucą (10 kolejka) i jedną bramkę w zakończonym takim samym wynikiem spotkaniu z Pachucą (12. kolejka).