W parlamencie frankfurckim Senff działał tylko do końca sierpnia 1848 r. Równocześnie był członkiem frakcji lewicowej Zgromadzenia Narodowego w Berlinie. Potem znalazł się wśród członków Izby Posłów sejmu pruskiego reprezentując kilka frakcji parlamentarnych. W latach 60. XIX w. był jednym z założycieli Deutsche Fortschrittspartei. W 1867 r. wycofał się z aktywnej działalności politycznej, a w 1869 r. opuścił również Bydgoszcz, przenosząc się do Drezna. W mieście tym zmarł, 4 maja 1879 r.
Zgodnie z ostatnią wolą zmarłego jego zwłoki zostały spopielone. Kremacji dokonano w pierwszym w Niemczech krematorium w Gocie. Urna z prochami 28 listopada 1879 r. została przewieziona do Bydgoszczy i złożona na cmentarzu ewangelickim przy ul. Jagiellońskiej.
Emil Senff był żonaty z Pauline z domu Hoyer. Miał kilkoro dzieci. W Bydgoszczy zamieszkiwał przy ul. Poznańskiej.
Honorowy Obywatel Bydgoszczy 16 września 1869 r. rada miejska Bydgoszczy podjęła uchwałę o nadaniu mu godności Honorowego Obywatela Bydgoszczy. W uzasadnieniu wyróżnienia